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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  46 lines
  1. *******************************************
  2. * Bombesin-like peptides family signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Bombesin-like peptides    comprise  a  large  family  of  peptides  which were
  6. initially isolated  from amphibian skin,  where they  stimulate smooth  muscle
  7. contraction. They  were  later  found  to  be widely  distributed in mammalian
  8. neural and  endocrine cells.   The  amphibian peptides  which  belong to  this
  9. family are currently classified into three subfamilies [1,2]:
  10.  
  11.  - The Bombesin group, which includes bombesin and alytesin.
  12.  - The Ranatensin  group,  which  includes ranatensins,  litorin,  and  Rohdei
  13.    litorin.
  14.  - The Phyllolitorin group, which includes Leu(8)- and Phe(8)-phyllolitorins.
  15.  
  16. In mammals and birds two categories of bombesin-like peptides are known [3,4]:
  17.  
  18.  - Gastrin-releasing peptide (GRP), which stimulates the release of gastrin as
  19.    well as other gastrointestinal hormones.
  20.  - Neuromedin B (NMB), a neuropeptide whose function is not yet clear.
  21.  
  22. Bombesin-like peptides, like  many other  active peptides, are  synthesized as
  23. larger protein  precursors  that are  enzymatically converted to  their mature
  24. forms. The  final peptides are eight to fourteen residues long. As a signature
  25. pattern, we  have  chosen  the  last   seven residues in the C-terminal, which
  26. are conserved and are essential for the biological activity.
  27.  
  28. -Consensus pattern: W-A-x-G-[SH]-[LF]-M
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31.  
  32. -Note: in positions 5 to 6 of the pattern, bombesins and GRP have His-Leu, NMB
  33.  and ranatensins have His-Phe, and phyllolitorins have Ser-(Leu or Phe).
  34.  
  35. -Last update: January 1989 / First entry.
  36.  
  37. [ 1] Erspamer V., Falconieri Erspamer G., Mazzanti G., Endean R.
  38.      Comp. Biochem. Physiol. 77C:99-108(1984).
  39. [ 2] Erspamer V., Melchiorri P., Falconieri Erspamer G., Montecucchi P.C.,
  40.      de Castiglione R.
  41.      Peptides 6 Suppl. 3:7-12(1985).
  42. [ 3] Spindel E.R.
  43.      Trends Neurosci. 9:130-133(1986).
  44. [ 4] Krane I.M., Naylor S.L., Helin-Davis D., Chin W.W., Spindel E.R.
  45.      J. Biol. Chem. 263:13317-13323(1988).
  46.